En la segunda sesión del juicio en la Audiencia Nacional contra la cúpula de los Mossos d'Esquadra durante los días álgidos del proceso independentista, el mayor Josep Lluís Trapero cuando ha sido preguntado si era consciente de los planes del gobierno de Carles Puigdemont para tener competencias plenas, ha afirmado que "no, claramente no" añadiendo que "de los planes estratégicos del gobierno (catalán) yo no tengo ni idea porque nadie me los ha comunicado".

El mayor Trapero también ha declarado que en dos reuniones que mantuvieron con el entonces director de los Mossos, Pere Soler, en el departamento catalán de Economía se le pidieron datos de la base de la policía catalana sobre la gestión de hoteles y apartamentos. Trapero ha asegurado que "querían la información por el tema fiscal. Nos negamos porque aquella base de datos es para temas de seguridad". El mayor ha añadido que en la segunda reunión en Economía "querían información sobre investigaciones de temas fiscales, les dije que no".

Sobre el papel del entonces consejero catalán de Interior, Joaquim Forn, el mayor Trapero ha afirmado que "el consejero de Interior siempre nos dijo que haría de consejero de Interior, independientemente de las manifestaciones públicas que hiciera", para remachar que "si nos engañó o nos traicionó, no le puedo decir otra cosa".