La decisió d'un jutge de Barcelona d'arxivar les querelles presentades contra els Mossos d'Esquadra arran de la intercepció de documents que la policia catalana pretenia destruir l'octubre del 2017 ha estat aprofitada per l'expresident de la Generalitat Carles Puigdemont per carregar contra El Periódico.
Després de saber-se que el jutge ha descartat que els Mossos espiessin per motius polítics, Puigdemont ha titllat a Twitter de "miserables" els responsables del diari: "Els miserables ho seran per sempre. Ells, els seus editors, els seus finançadors, els amics del rei… tot se sabrà. Paciència. Tenim temps: a les presons i a l'exili ens recordem cada dia de tots els miserables". Amb aquesta piulada, a més, ha difós una portada publicada per El Periódico fa un any, i difosa ara pel director de Vilaweb, Vicent Partal, on s'afirmava que "Els Mossos van intentar destruir l'alerta dels EUA".
Puigdemont, com el seu conseller d'Interior, Joaquim Forn, i el qui era el màxim responsable policial dels Mossos, el major Josep Lluís Trapero, se les van tenir amb el diari de Grupo Zeta per les informacions que va publicar sobre l'actuació dels Mossos amb relació a comunicacions de la intel·ligència nord-americana sobre possibles atemptats a Catalunya. Trapero i Forn, en particular, van assenyalar públicament El Periódico durant una roda de premsa.
L'exdiputat de Junts pel Sí Germà Bel, per la seva part, ha titllat d'"escòria periodística" El Periódico: "La dimensió de l'escòria periodística es mesura perfectament per la diferència entre l'espai i interpretació atorgat el 22 de Gener de 2018 a l'assumpte «documentació dels Mossos», i l'espai donat avui a l'arxivament de la causa. Cas d'estudi: «The Nota»". Per la seva part, l'exconseller Forn, actualment en presó preventiva, ha manifestat que "ara tocaria que polítics i mitjans que durant més d'un any s'han acarnissat contra la policia catalana demanessin perdó".
El director d’El Periódico, Enric Hernández, ha respost a Puigdemont i Bel: “Desafio als ex que amenacen o difamen i als seus believers (sincers o a sou) a aclarir què desmenteix el jutge sobre aquesta informació. Nega que l’alerta sobre la Rambla aparegués a la incineradora? No, diu que els dosiers sobre polítics eren legals. Prou mentides”.
