Els defensors de la seva innocència, entre els quals va destacar per la seva insistència i intensitat el columnista Salvador Sostres. El 2009, quan escrivia a l'Avui, va afirmar que els històrics de la Generalitat pujolista Lluís Prenafeta i Macià Alavedra eren "persones completament innocents" que "han estat injustament molestades per detencions efectistes i extemporànies que al final han acabat en no res", quan el magistrat Baltasar Garzón va ordenar detenir-los en el marc de la instrucció del cas Pretòria.

La sentència sobre aquell afer de corrupció s'ha conegut aquest dilluns. Alavedra i Prenafeta han esquivat la presó perquè han admès que van cobrar comissions del 4%, i han estat condemnats per tràfic d'influències i blanqueig de capitals. A més, Prenafeta ha de pagar 5,8 milions d'euros i Alavedra, 3,2 milions.

Un altre personatge públic que es va posicionar a favor dels dos històrics de Convergència va ser l'expresident Carles Puigdemont, bastant menys conegut el 2009. Quan va esdevenir president de la Generalitat, això sí, encara formava part a Facebook d'un grup d'usuaris que considerava injusta la situació de tots dos: "Prenafeta Alavedra Justícia Injusta". N'han format part altres figures públiques com el filòsof Bernat Dedéu, el sociòleg Salvador Cardús, l'historiador Jaume Sobrequés, els alts càrrecs de la Generalitat Roger Albinyana i Oriol Puig Godes, i l'eurodiputat Ramon Tremosa.

Prenafeta, en particular, té un vincle directe amb algunes figures públiques del sobiranisme liberal a través de l'extint think tank de l'òrbita convergent Fundació Catalunya Oberta (FCO), que ell mateix va fundar el 2001 i que va ser escorcollat per la Guàrdia Civil pel cas Pretòria.

El llistat de membres adherits de la FCO va incloure l'actual president de la Generalitat, Quim Torra, així com la presidenta en funcions de la CCMA, Núria Llorach, els columnistes Salvador Sostres, Enric Vila i Francesc-Marc Álvaro, i els filòsofs Bernat Dedéu, Jordi Graupera i Francesc Puigpelat.

L'actual director de TV3, Vicent Sanchis, va esdevenir el 2012 director de la FCO, mentre que un dels seus predecessors al capdavant de la televisió pública catalana, Joan Oliver, era president del think tank. La cúpula de la FCO també va ser el punt de trobada de l'economista Xavier Sala-i-Martin i dos exdirectors de TV3 més: Enric Canals i Lluís Oliva. L'exconseller Macià Alavedra i l'exdiputat de CiU i exdirector de la CCMA Vicenç Villatoro també van ser membres del patronat.

Sanchis, per cert, va escriure amb Prenafeta el llibre El malson, sobre l'estada de 43 dies de l'expolític en presó preventiva. "Hi ha hagut un excés del tot injustificat i unes víctimes que hem sofert decisions desmesurades de gent que no és conscient del mal que fa. Gent arbitrària, prepotent, injusta. Volien que fos un mort civil. Ho superaré, però no ho oblidaré", hi expressava Prenafeta.